Šolo upravljata ravnateljica in svet zavoda. Svet zavoda ima štiriletni mandat. Sestavljajo ga trije predstavniki ustanovitelja, pet predstavnikov delavcev zavoda in trije predstavniki sveta staršev, ki imajo mandat v skladu z odlokom o ustanovitvi javnega vzgojno izobraževalnega zavoda OŠ Lovrenc na Pohorju.